Что делать, если самозанятый с оформленными на себя товарными знаками решил стать индивидуальным предпринимателем или учредить фирму?

На момент регистрации фирмы, самозанятый уже будет правообладателем товарного знака. Для передачи прав на товарный знак юридическому лицу между самозанятым и компанией нужно будет заключить договор отчуждения исключительного права на товарный знак и зарегистрировать его в Роспатенте. Сделав это, вы получите от ведомства приложение к свидетельству на товарный знак, а сведения о регистрации факта перехода права будут внесены в государственные реестры Роспатента. 

Правда, далеко не всегда права на товарный знак стоит передавать компании — во многих случаях достаточно будет заключить лицензионный договор и получать отчисления в ваш адрес, особенно если компанию вы будете создавать уже не единолично, а с партнерами. Если же в ходе развития бизнеса вы поменяете статус с самозанятого на ИП, то товарный знак останется за вами как физическим лицом в любом случае, и ничего делать не потребуется.